1、環境與池塘消毒
草魚最容易生病，養殖無公害草魚應有專門的養殖基地，並形成一定的規模，基地周圍無汙染源。養殖基地應具備水源充足，水質良好，進排水暢通，魚塘之間互不相通，交通運魚方便，飼料資源豐富，生態環境條件良好。
2、優質魚種的放養
要想養好草魚，必須選用健康活潑的優質魚種，自繁自育的魚種的親本應來源於有資質的國家認定的原料場，苗種經無公害培育而成，質量符合相關標準，具備品種優良性狀，條件具備的最好自繁自育為好，如從外地引進魚種須經檢疫合格方能引入。魚種放入前須經消毒處理，可選用二氧化氯每5－10分鐘20－40毫克／升、食鹽每5－20分鐘用1％－3％、每15－30分鐘用8毫克／升，高錳酸鉀每15－30分鐘10－20毫克／升等藥物浸泡消毒。放養比例按80∶20放養模式投放魚種，即主養草魚佔80％，配養魚(鰱、鱅、鯉、鯽等)佔20％。
3、科學投餌
草魚在自然水域主要取食水草，在池塘無公害養殖中，適宜採用配合科學配比的顆粒飼料，減少殘餌對水質的汙染，充分提高餌料利用率。生產草魚顆粒飼料，應加入一定量的草魚粉，既可降低餌料成本，又能滿足草魚對纖維素等特殊營養的需求，促進草魚生長。搭配投喂的水旱草、應柔嫩、新鮮、適口。餅粕類及其他類餌料，要無黴變、無汙染、無毒性，並經粉碎、浸泡、煮熟等方式處理後，製成草魚便於取食、易於消化的餌料。投喂餌料要堅持定時、定位、定質、定量的投餌原則，還要通過觀察天氣、水體情況及魚的吃食量確定合理的投喂量。
4、合理投喂漁藥
漁藥是用於預防和治療水產動植物病蟲害的物質，如果使用不當，極易在魚體內殘留，造成魚的質量不合格，因此要慎重使用。漁藥一般包括殺菌劑、滅蟲劑、水質改良劑等，目前一些傳統漁藥已被禁用，如氯黴素、呋喃唑酮、五氯酚鈉、孔雀石綠、磺胺噻唑、泰樂菌素、喹乙醇、磺胺脒、殺蟲脒等32種漁藥，不能在水產養殖中使用，在選用漁藥時應特別注意。在農業部頒佈的行業標準中列出了宜用漁藥26種，如二溴海因、優氯淨、漂白粉、氯化鈣、強氯精，並規定了用途及用法，休藥期和注意事項，在使用時可參考。