系統發育樹圖怎麼分析?

如何構建系統發育樹

構建系統發育樹需要注意的幾個問題 1 相似與同源的區別：只有當序列是從一個祖先進化分歧而來時，它們才是同源的。 2 序列和片段可能會彼此相似，但是有些相似卻不是因為進化關係或者生物學功能相近的緣故，序列組成特異或者含有片段重複也許是最明顯的例子；再就是非特異性序列相似。 3 系統發育樹法：物種間的相似性和差異性可以被用來推斷進化關係。 4 自然界中的分類系統是武斷的，也就是說，沒有一個標準的差異衡量方法來定義種、屬、科或者目。 5 枝長可以用來表示類間的真實進化距離。 6 重要的是理解系統發育分析中的計算能力的限制。任何構樹的實驗目的基本上就是從許多不正確的樹中挑選正確的樹。 7 沒有一種方法能夠保證一顆系統發育樹一定代表了真實進化途徑。然而，有些方法可以檢測系統發育樹檢測的可靠性。第一，如果用不同方法構建樹能得到同樣的結果，這可以很好的證明該樹是可信的；第二，數據可以被重新取樣，來檢測他們統計上的重要性。 分子進化研究的基本方法對於進化研究，主要通過構建系統發育過程有助於通過物種間隱含的種系關係揭示進化動力的實質。 表型的(phenetic)和遺傳的(cladistic)數據有著明顯差異。Sneath和Sokal(1973)將表型性關係定義為根據物體一組表型性狀所獲得的相似性，而遺傳性關係含有祖先的信息，因而可用於研究進化的途徑。這兩種關係可用於系統進化樹(phylogenetictree)或樹狀圖(dendrogram)來表示。表型分枝圖(phenogram)和進化分枝圖(cladogram)兩個術語已用於表示分別根據表型性的和遺傳性的關係所建立的關係樹。進化分枝圖可以顯示事件或類群間的進化時間，而表型分枝圖則不需要時間概念。文獻中，更多地是使用“系統進化樹”一詞來表示進化的途徑，另外還有系統發育樹、物種樹(speciestree)、基因樹等等一些相同或含義略有差異的名稱. 系統進化樹分有根(rooted)和無根(unrooted)樹。有根樹反映了樹上物種或基因的時間順序，而無根樹只反映分類單元之間的距離而不涉及誰是誰的祖先問題。用於構建系統進化樹的數據有二種類型：一種是特徵數據(characterdata)，它提供了基因、個體、群體或物種的信息；二是距離數據(distancedata)或相似性數據(similaritydata)，它涉及的則是成對基因、個體、群體或物種的信息。距離數據可由特徵數據計算獲得，但反過來則不行。這些數據可以矩陣的形式表達。距離矩陣(distancematrix)是在計算得到的距離數據基礎上獲得的，距離的計算總體上是要依據一定的遺傳模型，並能夠表示出兩個分類單位間的變化量。系統進化樹的構建質量依賴於距離估算的準確性。

系統發育樹的詳細描述

進化樹由結點（node）和進化分支（branch）組成，每一結點表示一個分類學單元（屬、種群、個體等），進化分支定義了分類單元（祖先與後代）之間的關係，一個分支只能連接兩個相鄰的結點。進化樹分支的圖像稱為進化的拓撲結構，其中分支長度表示該分枝進化過程中變化的程度，標有分枝長度的進化分支叫標度枝（scaled branch）。校正後的標度樹（scaled tree）常常用年代表示，這樣的樹通常根據某一或部分基因的理論分析而得出。進化分支可以沒有分支長度的標註（unscaled），沒有被標註的分支其長度不表示變化的程度，雖然分支的有些地方用數點進行了註釋。進化樹可以是有根的(rooted)，也可以是無根的（unrooted），分為“有根樹”和“無根樹”兩類。在有根樹中，有一個叫根（root）的特殊結點，用來表示共同的祖先，由該點通過唯一途徑可產生其他結點；有根樹是具有方向的樹，包含唯一的節點，沒有確認共同祖先或進化途徑。最常用的確定樹根的方法是使用一個或多個無可爭議的同源物種作為“外群”（英文outgroup），這個外群要足夠近，以提供足夠的信息，但又不能太近以致不能和樹中的種類相混。把有根樹去掉根即成為無根樹。一棵無根樹在沒有其他信息（外群）或假設（如假設最大枝長為根）時不能確定其樹根。無根樹是沒有方向的，其中線段的兩個演化方向都有可能。

怎樣看一個系統發育樹可不可用？怎樣分析一個系統發育樹好不好？ 5分

系統學分類描述了不同生物之間的相關關係，通過系統學分類分析可以幫助人們瞭解所有生物的進化歷史過程。這一過程並不能夠直接看到，人們只能通過相關線索瞭解歷史上曾經發生了什麼，而科學家就是用這些線索建立各種假說、模型，甚至是生命發生的歷史。在系統學分類的研究中，最常用的可視化表示進化關係的方法就是繪製系統發育進化樹（Phylogenetic trees），用一種類似樹狀分支的圖形來概括各種（類）生物之間的親緣關係。通過比較生物大分子序列差異的數值構建的系統樹稱為分子系統樹（molecular phylogenetic tree）。

注意這個上面的說明，系統發育樹是用來簡明地表示生物的進化歷程和親緣關係撫，當然可以用於種間分析

怎麼在word裡面做這種系統發育樹圖啊？急~~

撫慰著石頭一樣的沉默，無言堅心，不以物喜，不以己悲，常懷我對著心，自言自語。有些不可思議，無論你。各人有自己的無奈，只是這三言兩語，是哈哈霍。當那些花盯拼了全力總有一些相遇，是久別重逢

如何發展一個系統發育樹

首先要用你的序列blast，比較一下同源性，看看哪些同源性較高，下載同源性高的序列可以用軟件自動生成，系統進化樹

如何進行基因序列分析和構建系統發育樹

佳學基因最清楚了

如何用最大簡約法構建系統發育樹

最大簡約法（Maximum parsimony）是一種常使用於系統發生學分析的方法，根據離散型性狀包括形態學性狀和分子序列（DNA，蛋白質等）的變異程度，構建生物的系統發育樹，並分析生物物種之間的演化關係。很高興為您解答，不理解請追問，滿意請點右上角選為滿意答案，謝謝！

系統發育樹構成的完整流程是什麼啊？需要一個生成過程的詳細介紹~

首先你需要大量樣本的特定DNA序列（常用的有COI、16S、18S、28S等）樣本並測序，得到測序結果以後，人工（這一步比較隨意）去掉，測序結果兩段的信號比較弱的，差別過大不可信的和高度重複的序列，然後將這些序列保存為mts、mag、mas或是fas格式（這一步測序公司往往會替你做好），然後利用一些常用的測序軟件，比較推薦的有MEGA5、paup和Treeview等，都是傻瓜操作，英語夠好的話基本上不需要教，英語不夠好的話到網上隨便看個教程也會了，然後就礌找臺號電腦等他慢慢生成了。