國債期貨期現套利可採用延遲進入交易的模式，即以可交易的較低價格買入國債，保證手頭持有可交割的現券用於交割，並在現券持有期間可獲得一定的利息收益，而在國債期貨市場以可交易的較高價格賣出適當數量的期貨合約。
做國債期現套利，本質上要了解現貨，瞭解影響國債市場的因素，如國內外巨集觀經濟形勢以及國內市場資金狀況等。
如何投資國債期貨以取得好的投資收益？這是一個有待交易所確定國債期貨合約規格以及交易交割規則後才好進行研究的問題。現階段國債期貨模擬交易以系統測試為主，由於機構尚未基於套期保值或進行套利的需求入市，目前市場執行資料並不足以用來研究策略。
在海外，國債期貨主要作為盈利和對衝的工具使用。全球CTA投資的品種有200多個，其中國債期貨佔倉位的一半以上。多年來不管股市漲跌，CTA指數都取得正收益，這與國債期貨在CTA策略中的廣泛應用不無關係。國債期貨在對衝時可運用的策略有可轉債套利、企業信用債套利、事件驅動 策略和企業資本結構套利等。
與以前的國債期貨相比，此次將要推出的國債期貨在實物交割制度上進行了很大完善。以前國債期貨僅對應一隻可交割債券，一家有資金和現券優勢的機構，如果在交易過程中操縱現貨、期貨價格，就可能會出現逼倉現象，但是現在的國債期貨可交割債券是最後交割日剩餘期限4至7年（不含7年）的固定利息國債。
這樣的設計有較大的好處：一是可交割的國債品種範圍較寬、存量規模較大，不易被機構操作價格；二是投資者可以根據轉換因子換算，選擇最便宜交割債券進行交割。