主成分分析(PCA)是排序分析(Ordination)的一種,常用於生態學領域。本文介紹如何用Past做主成分分析
工具/原料
Past軟體
方法/步驟
Past資料匯入及樣品分組方法見《Past統計分析軟體資料匯入及分組方法》,最終得到如圖所示的資料形式。
首先Ctrl+A全選資料
0 Past統計分析軟體資料匯入及分組方法
Multivariate選單--Ordination--Principle Components (PCA)
Summary選項卡列出了每個座標軸的Eigenvalue值及其所佔百分比。
如果修改了執行引數,需要點選Recompute重新計算
Scatter Plot選項卡給出了PCA圖,右邊有若干選項(例如是否顯示樣品標籤)
點選“Graph Setting”按鈕可設定更多作圖選項
如圖可增加圖片的外邊框,將座標軸由中間位置改為在邊框上。
可選擇多種圖片格式(SVG是向量圖,最清晰),點選Picture按鈕可儲存圖片。
Scores選項卡顯示樣品點在PCA圖上的座標,點選Copy複製全部內容,可貼上到excel中。
注意事項
本經驗適用於Past 3.x,低版本Past的操作介面略有不同