症狀
菸草普通花葉病毒病
自苗床期至大田成株期均可發生。移栽後20天到現蕾期，為發病高峰期，打頂後田間病株仍呈上升趨勢，但主要在煙杈上顯症，為害不大。幼苗被侵染後，新葉的葉脈組織變淺綠色，呈半透明的“明脈症”，迎光透視可見病葉大小葉脈十分清晰，幾天後葉片形成黃綠相間的“花葉症”。大田期，煙株受侵染後，首先在心葉上發現“明脈”現象，以後呈現花葉、泡斑、畸形、壞死等典型症狀。輕型花葉只在葉片上形成黃綠相間的斑駁，葉形不變。重型花葉症狀為葉色黃綠相間成相嵌狀，深綠色部分出現“泡斑”，葉子邊緣逐漸形成缺刻並向下捲曲，葉片皺縮扭曲，有些葉片甚至變細呈帶狀。早期感病植株矮化，生長停滯，葉片不開片，正常開花但果實種子發育不良。除典型花葉症狀外，在旺長期病株中上部葉片還會出現紅褐色大壞死斑，稱為“花葉灼斑”。菸草普通花葉病的個別株系還可以在菸葉上形成系統花葉的同時，在中下部葉片上產生環斑或壞死斑。早期發病的植株嚴重矮化，生長緩慢，不能正常開花結實。能發育的蒴果小而皺縮，種子量少且小，多不能發芽。
菸草黃瓜花葉病毒病
本病的症狀隨侵染的黃瓜花葉病毒株系不同而有所差異。初期發病，首先在心葉上表現明脈症，葉色濃淡不均，出現黃綠相間的“花葉症”狀。嚴重時，葉片變窄、扭曲，伸直呈拉緊狀，表皮茸毛脫落，失去光澤等。早期患病，植株嚴重矮化，基本無利用價值。大田期的典型症狀有：①葉片顏色深淺不均，形成典型的“花葉症”。②上部葉狹窄、葉柄拉長，葉緣上卷葉尖細長，呈“畸形狀”。③有時病葉上出現深綠色的“泡斑”。④中部葉或下部葉可形成“閃電狀壞死”，褐色至深褐色。⑤小葉脈或中脈形成深褐色或褐色壞死。CMV與TMV的症狀區別：TMV的病葉邊緣時常向下翻卷不伸長，葉面絨毛不脫落，泡斑多而明顯，有缺刻；而CMV的葉片，病斑邊緣時常向上翻卷，葉基拉長，兩側葉肉幾乎消失，葉尖成鼠尾狀，葉面絨毛脫落，泡斑相對較少，有的病葉粗糙，如革質狀。
菸草馬鈴薯Y病毒病
由於病毒株系不同而表現出不同症狀。發病初期，新葉上表現明脈現象，此後由於病毒株系不同，引起的症狀也有差異。要有脈帶花葉型、脈斑型和褪綠斑點型。脈帶型：在煙株上部葉片呈黃綠花葉斑駁，脈間色淺，葉脈兩側深綠，形成明顯的脈帶，嚴重時出現卷葉或灼斑，葉片成熟不正常，色澤不均，品質下降，煙株矮化。脈斑型：下部葉片發病，葉片黃褐，主側脈從葉基開始呈灰黑或紅褐色壞死，葉柄脆，摘下可見維管束變褐，莖稈上出現紅褐或黑色壞死條紋。褪綠斑點型：初期與脈帶型相似，但上部葉片出現褪綠斑點．後中下部葉產生褐色或白色小壞死斑，病斑不規則，嚴重時整葉斑點密集，形成穿孔或脫落。
發病特點
普通花葉病毒主要靠汁液擦傷傳播。在土壤中的病殘體內的病毒，可存活兩年，在乾燥的菸葉裡的病毒可存活數十年之久，都可導致苗床和大田煙株發病。另外，田間管理或風雨使病、健株摩擦，而引起發病。黃瓜花葉病則主要靠蚜蟲(菸蚜、棉蚜)傳播，其次是汁液擦傷傳病。由於這一種病毒寄生範圍極廣，可在越冬蔬菜及多年生雜草體內越冬，成為來年侵染草的初侵染源。因而村邊、地頭煙株發病早、受害重。菸草自移栽到旺長階段，若遇雨天，溫度較低，蚜蟲數量多，將導致病害流行。
防治方法
（1）栽種抗耐病品種 這是防治菸草病毒病既經濟、又有效的根本途徑。選用無病株上的種子，從無病株上採種，單收、單藏，並進行細緻汰選，防止混入病株殘屑。
（2）加強苗床管理，培育無病壯苗。首先要注意苗床選地，苗床要儘可能遠離菜地、烤房、晾棚等場所。其次床土及肥料不可混入病株殘屑，注意清除苗床附近雜草。及時間苗、定苗，合理施肥澆水、有效地控溫控溼。操作時要用肥皂水洗手，嚴禁吸菸，盡力減少操作工具、手、衣服與煙株接觸。
（4）適當提早播種、提早移栽。移栽時要剔除病苗。注意煙田不與茄科和十字花科作物間作或輪作，重病地至少要二年內不栽種菸草。
（5）加強田期管理，提高菸草的自然抗病能力。煙田要在冬前進行深翻晒土，翌年翻漿時反覆細緻耙地，熟化耕作層，減少侵染毒源。
（6）田間操作時，事先要用肥皂水洗手，工具要消毒，並禁止吸菸。打頂抹杈要在雨露幹後進行，並注意病株打頂、抹杈要最後進行。
（7）注意驅避蚜蟲、防其傳毒。育苗床和煙田，鋪設銀灰色地膜、或張掛銀灰色反光膜條，可有效地驅避蚜蟲向煙田內遷飛。
（8）生物防治：
預防一：菸草病毒病專用每包40克兌水15公斤，進行植株全面噴施，每7天用藥1次。治療：發病率≤5%，使用 菸草病毒病專用，按40克兌水15公斤，連用2天，7天1個療程，連用2個療程，病情得到控制後，改用預防方案。 5%≤發病率≤20%，使用菸草病毒病專用60g，兌水15公斤，連用2天（間隔24小時），7天1個療程，連用2個療程，病情得到控制後，改用預防方案。
方案二：將“TY病毒Ⅱ號”按450倍液稀釋，進行全株託噴，7天1次。