最新超級計算機病毒母體研究

　　編制或者在計算機程式中插入的破壞計算機功能或者破壞資料，影響計算機使用並且能夠自我複製的一組計算機指令或者程式程式碼被稱為計算機病毒Computer Virus。具有破壞性，複製性和傳染性。以下是網小編為大家整理的關於超級計算機病毒母體研究的相關知識，希望對大家有所幫助!

　　HIV病毒研究是各國科學家都非常關注的一個重大課題，對它的分析研究往往需要進行大量高密度的計算。計算機的效能和可靠性對研究進展起到了非常關鍵的作用。近日，雲南大學的科研人員在新引進的曙光4000A超級計算機上進行了HIV 病毒gp120 糖蛋白分子動力學模擬實驗，運算時間從以往通過單機需要一星期縮短到了13個小時。

　　位於中國西陲的雲南大學已經擁有了80餘年的歷史，是國家“211工程”重點建設的高校之一。隨著教學科研工作的不斷深入，各學科對大型、密集、高效能運算的需求與日俱增，材料科學、資訊科學、數理化、生命科學、地理和大氣科學的科研人員都急需一個能提供高效能運算服務的平臺，而分散在各學院和實驗室的現有計算資源都無法滿足如此大規模的計算需求。

　　為了解決這一矛盾，雲南大學從 211建設經費中劃撥出了專款，要建一個高水平的高效能運算中心!這一中心不僅要能實現高速網路環境下多種計算資源的有效聚合與充分共享，為各學科提供高效能運算服務，而且要為雲南省重要領域的大型計算軟體開發提供支撐，並逐步形成多學科交叉和創新研究的平臺。

　　上海超算採用中國最快超級計算機10萬億曙光4000A成功部署國家網格和上海資訊服務平臺的做法在國內外引起了廣泛的關注，也同樣成為雲南大學的參考樣板。雲南大學的領導在對上海超算和曙光公司進行實地考察，並在曙光技術支援部的高效能運算測試實驗室中進行軟體測試後，一個採用曙光4000A搭建高效能運算中心的藍圖開始萌生。

　　9月，雲南大學高效能運算中心正式成立，新引進的曙光4000A也開始投入執行。這套基於機群架構的超級計算機系統採用了96顆AMD皓龍處理器，配備了192GB海量記憶體和2044GB外部儲存，峰值計算速度達到了每秒 3840 億次，在11月公佈的2005年中國高效能運算機效能TOP 100排行榜中，排第89位。中心通過採用國際標準超級計算機效能測試標準 HPL 程式對曙光4000A進行了 Linpack 測試，系統 Linpack 運算與峰值比為 75.83% ，比上海超算曙光4000A 還要高出近4個百分點。

　　據云大高效能運算中心技術負責人介紹說，引進的曙光4000A是個中等規模的機群系統，由高速計算網、儲存接入網和管理監控網等3套網路組成，其中24個計算節點全部採用2U高密度的機架式四路伺服器天闊R4280A。由於該伺服器採用了AMD皓龍64位處理器，具有直連架構、HT超傳輸技術、整合記憶體控制器等特點，加上曙光自主研發設計的四路主機板，節點機和機群系統的效能和穩定性都得到了很好的保障。該款產品僅在上海超算就部署了500多個節點，平均無故障執行時間達到了25萬小時的驚人品質。

　　在試執行階段，高效能運算中心聯合校內的多家相關研究單位，針對一些成熟的高效能運算應用課題做了初期聯合測試，測試結果達到預期效能指標。生命科學院生物資源保護與利用重點實驗室使用 Gromacs 分子動力學模擬軟體從事 HIV 病毒 gp120 糖蛋白分子動力學模擬實驗，在執行 24 個節點、每節點 1CPU的 條件下，1ns 蛋白質結構模擬僅需13小時，而以往在單機上要執行整整一個星期。資源環境與地球科學學院大氣數值模擬實驗室則進行了黑炭氣溶膠輻射氣候效應的數值試驗，即通過使用區域氣候模式 Regcm3 模式對 2001-2002 年 BC 氣候效應進行數值模擬，以往在普通 PC 單機上執行需要 96 小時，目前使用該系統單節點僅需 48 小時，縮短了一半。

　　目前，高效能運算中心在前期調研的基礎上，部署了許多應用軟體，涉及大規模非線形複雜系統的計算和模擬、有限元計算、流體動力學計算模擬、分子動力學計算及力場模擬、計算化學與藥物篩選等領域，校內使用者已可通過網路遠端登陸並提交相關計算作業。

　　雲大高效能運算中心副主任李漢斌表示：“我們也曾嘗試過自己搭建整合系統，但十分不穩定而且速度慢，這次採用曙光4000A機群伺服器，穩定性非常好，到目前還沒有出現過宕機現象，並且速度也明顯提高了好多倍。曙光4000A機群系統的引入有效地解決了雲大在材料科學、生命科學、大氣科學等學科基礎研究上的高效能運算應用需求，同時也為雲南各行各業科學研究和經濟建設提供了良好的服務。”

　　為了更好地推動高效能運算在雲南省科學研究與經濟建設中的應用，進一步提高雲南省科技創新能力，為雲南省培養高效能運算研發和應用方面的高層次專門人才，雲大高效能運算中心先後與中科院計算所、上海超算、曙光、 AMD、中科院昆明植物所以及上海藥物所等多家單位建立了全面的合作關係，相繼成立上海超算雲南大學分中心、雲南大學-中科院計算所高效能運算聯合實驗室、雲南大學-曙光公司高效能運算技術支援中心、AMD64高效能運算教學科研實驗室等多個研發平臺，為推動雲大深入開展高效能運算的教學、科研和應用奠定了良好的基礎。

　　曙光公司銷售總監王成江表示，隨著機群技術的日漸成熟，機群伺服器已經教育都會網路、高校資訊化和教育科研網格建設中得到廣泛青睞。在西部四十多所高校校園網，北京、煙臺、上海、南陽等地都會網路以及中山大學、北京郵電大學等重點高校的教育科研網格專案中，曙光機群伺服器中的TC1700、曙光3000以及最新一代的曙光4000系列機群伺服器實現了廣泛部署。雲南大學高效能運算中心的建立和曙光4000A的成功執行，對西南地區高效能運算應用將起到非常好的示範和輻射效應，帶動其他行業通過高效能運算來提升業務效率和科技競爭力。