基因功能分析?
怎樣確定一個基因的功能
首先看看你的這個基因是否在基因庫裡是否有相關類似的報道,然後進行功能鑑定,確定其是有什麼樣的個功能,是不是個完整的基因等.
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1, 首先確定是一個完整的基因,有上游完整的啟動子序列,下游的終止序列.
2, 是否有明確的功能
3, 同源性比較:若有功能,同源性很高也算新基因.(看你自己的要求,不同物種相同功能的同源性很高但有差異也可以叫新基因. 單若有功能,並且同源性很低,那就是真正的新基因了!)
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首先要拿到 mRNA序列,最好是全序列。用RACE方法拿全長。然後對其表達 蛋白進行預測,選定最長的通讀筐,將mRNA,蛋白進行庫的序列對比,看是否有人已經報道。
從基因文庫中預測蛋白二級結構,找其中的domain, 看時候有同源蛋白活則domain的報道。如果都沒有,肯定是新基因。
從mRNA水平看其表達情況,看能否進行功能分析,可以做到的話,基因如果很重要,可以發到nature 或science文章的。
不過有很多地方是分開發文章,怕比人超越。
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我個人的一些體會
1、一定好好搜索數據庫,如果和某個已知基因的相似性達到了百分之八、九十,新基因的結論就要慎重了。
2、一定要做個Southerm blot。
3、必須有比較充分的功能的證據,比如完整的讀碼框;Northern也證實有轉錄等。
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求助,這個基因功能區分析是什麼意思
這個基因功能區分析是什麼意思
①分子雜交的原理是鹼基互補配對原則.
②由於一種氨基酸可能對應多種密碼子,所以在已知a基因編碼的氨基酸排列順序的情況下,也不能確定a基因轉錄的mRNA的鹼基排列順序.
③轉錄需要RNA聚合酶的參與,該酶能識別和結合基因首端的啟動子.
④減數第一次分裂後期,由於同源染色體的分離,含有突變基因的染色體分配到次級卵母細胞的概率為;減數第二次分裂後期,由於著絲點分裂,子染色體移向兩極,含有突變基因的子染色體分配到卵原細胞的概率為,因此卵細胞攜帶該突變基因的概率是
①鹼基互補配對原則
②不能 一種氨基酸可能對應多種密碼子
③RNA聚合酶
如何鑑定某個基因的功能
對於基因功能的研究一般的思路是,把這個基因沉默了,也就是不讓它表達了,看看植物有什麼變化,另外,可以把這個基因的表達提高,也就是過表達,再看看對植物有什麼影響,通過這兩方面基本就可以推測其功能了。
什麼是功能基因組學
基因組(Genome)是指一個細胞或者生物體所攜帶的一套完整的單倍體DNA(部分病毒是RNA)序列。基因組學(Genomics)則是指對所有基因進行基因組作圖、核苷酸序列分析、基因定位和基因功能分析的一門學科。
功能基因組學(Functuional genomics)又被稱為後基因組學(Post-genomics),它利用基因組所提供的信息,發展和應用新的實驗手段,在基因組或系統水平上全面分析基因的功能,生物學研究因此從對單一基因或蛋白質的研究轉向對多個基因或蛋白質同時進行系統的研究。這是在基因組靜態的鹼基序列被測定之後轉入對基因組動態的生物學功能學研究。研究內容包括基因功能發現、基因表達分析及突變檢測。基因的功能包括:生物學功能,如作為蛋白質激酶對特異蛋白質進行磷酸化修飾;細胞學功能,如參與細胞間和細胞內信號傳遞途徑;發育生物學功能,如參與形態建成等。採用的手段包括基因表達的系統分析(serial analysis of gene expression, SAGE)、cDNA微陣列(cDNA microarray)、DNA 芯片(DNA chip)等,而且有關的新技術還在不斷地被開發出來。