注意事項
除了劇情當中有人帶路的情況，任何目標地點都可以在差點沒頭的尼克指引下到達目的地，如路上遇到移動的樓梯，靜靜等待一段時間，待其恢復原位即可。
遊戲當中有3個小遊戲，分別是：魔藥製作，魔法決鬥以及魁地奇，在相應的地點完成指定任務可以獲得徽章，分為金，銀級別，而這些徽章大多數都是與成就直接掛鉤的。
遊戲當中有150枚霍格沃茨勳章需要取得，獲得方法有直接獲得，使用魔法獲得，以及收集一定數量的迷你勳章獲得。
魔法
Charm類
WingardiumLeviosa（羽加迪姆勒維奧薩，即懸浮咒）：RS從右至左劃下半圓，再從左至右劃下半圓，可使物體飛行，LS控制物體移動。
Reparo（恢復如初）：RS順時針旋轉，可使損壞物體復原。
Incendio（火焰熊熊）：RS向下向上各推一次，可使煙花燃放。
Dueling類
Stupefy（昏昏倒地）：向上推RS，普通直線攻擊。
Protego（盔甲滬身）：向下推RS，反彈攻擊。
Expelliarmus（除你武器）：RS，LS分別向外推，可將敵人擊倒，推薦。 Levicorpus（倒掛金鐘）：RS，LS同時向右推，可將敵人倒掛，推薦。
Charging（？）：RS向下推敘力，向上推射出，敘力時間越長，威力越大
步驟/方法
遊戲以斯內普和納西莎。馬爾福訂立牢不可破的誓言作為開場（看過原著的人想必都知道他們立的是什麼誓言），之後正式進入哈里波特的冒險旅程。
來到陋居，這裡哈里波特首先要進行一個飛行的小遊戲，在飛行過程中穿越標誌直到抓住金色飛賊即可，值得注意的是，這裡RS向下是上升，而向上反而是下降，所以這裡要注意不要被方向搞混淆。
完成任務後暫時與金妮告別，與赫敏和羅恩對話後開始練習WingardiumLeviosa，方法是用RS從左至右，然後再從右至左連劃兩個下半圓，之後控制左搖桿將其移到指定的位置，再連續向前推兩下RS使其飛出即可達成。剩下的3個目標可以用來熟悉這一咒語。
隨著劇情的發展，哈利波特身著隱身衣跟蹤馬爾福來到斯萊哲林的車廂，不過卻被馬爾福發現並攻擊。好在盧娜發現了他。兩人一起向城堡跑去，中途可以收集霍格沃茨的勳章。而畫面中閃亮的目標，哈利則可以向前推兩下RS取得遊戲當中的迷你勳章，獲得一定數量的迷你勳章則可以交換霍格沃茨的勳章。進到城堡，哈利恰好聽到宣佈新任老師的人選，而擔任和魔法防禦術老師的，正是哈利的死敵“斯內普”。遊戲解開新的區域。
當麥格教授解釋完哈利可以繼續修學魔藥學的原因後，按BACK鍵可以呼喚出差點沒頭的尼克，在以後的遊戲中，只要將尼克呼喚出來，他就會作為玩家的引導者指引玩家的前進。而在行進的過程當中，樓梯會不斷的移動，玩家只要耐心等待即可。
跟隨尼克來到斯拉格霍恩的魔藥教室，由於沒有教科書，哈利只能從教室的舊書中取得一本。在這裡哈利波特要開始配製魔藥。按A選擇右邊按形狀提示的藥瓶，移動到坩堝處，點擊右搖桿倒入坩堝配製成後面提示的顏色即可，而當右側提示出現火焰形狀的時候，按左搖桿連續上下加熱魔藥就可以改變魔藥顏色並達到要求。屏幕上方會有時間的限制，每完成一步可以適當的增長時間條，而一旦玩家出現太多次錯誤的話，時間條則會急劇的下降，並出現煙霧，連點RT，LT可以去除煙霧。反複製作不同的魔藥以後，斯拉格霍恩讚揚了哈利的天賦，並將一瓶能夠帶來幸運的福靈劑送給哈利作為表現出色的獎勵。
來到決鬥俱樂部，這裡哈利要和羅恩給其他同學示範決鬥技巧，也就是教學步驟。第一個咒語是Stupefy，將左搖桿向上推不斷攻擊羅恩將其推下決鬥臺即可。而之後的演示按RT和LT鍵可以躲避羅恩的攻擊。Expelliarmus的發動方法是同時將左右搖桿向外側移動。教學完成後將有一場哈利和羅恩3局2勝制的戰鬥，只要使用Expelliarmus將其反覆擊倒，中間夾雜Stupefy即可輕鬆制勝。之後可以開啟決鬥者俱樂部的比賽，在門口的木板上可以選擇戰鬥對手。
來到鄧不利多的辦公室，並與其進入冥想盆，探尋伏地魔的曾經，並解開新的區域。之後跟隨凱蒂準備進行魁地奇的訓練，在通往賽場的路上，高爾將前進的鐵門封住，來到被封閉的鐵門前發動Reparo，（用右搖桿順時針旋轉）組合出鑰匙即可打開鐵門。繼續隨凱蒂前進來到魁地奇的的休息室，路途中還要面對一場和高爾的決鬥。
來到休息室，這次哈利要作為隊長選擇格萊芬多新的魁地奇球員，穿越每個標誌可以獲得加速的效果，同時躲避障礙物與對手的碰撞可以取得金色飛賊。之後羅恩取得格萊芬多守門員的位置。之後可以在左面的板上選擇魁地奇的練習項目。
與金妮對話後，哈利要幫助她解決Shinrinking的解決方案，首先來到草藥學教室，卻被告知首先加入魔藥俱樂部去報到才能使用這裡的資源。使用右邊的題板提示完成第一種魔藥即可加入。之後為金妮配製Shinrinking，這次的魔藥配製增加了首先搖晃瓶體直至發出氣泡，以及向坩堝加入固體的步驟，不過沒有難度，根據提示完成魔藥。
在去將魔藥交給金妮的路上碰上克拉布，再次觸發決鬥，克拉布就像他的長相那麼愚蠢，完全不是哈利的對手。在戰鬥中學會Protego，可以反彈敵人的攻擊，同時也掌握了可以敘力的Changing。
將魔藥交給及金妮後，發生在霍格莫德凱蒂遭到攻擊的劇情。回到霍格沃茨，此時將要面對與斯萊哲林的魁地奇比賽，不過在這之前先要將阻擋哈利的對手幹掉。本關還是儘量使用Expelliarmus將其擊倒，之後連續攻擊不給其反擊餘地即可，注意這次由於敵人會使用Protego，可以反彈你的攻擊，所以在敵人發動這一咒語時，要及時暫緩攻勢。
來到魁地奇賽場準備開始比賽，在這之前熱身是必不可少的，依然是穿越標誌的小遊戲，在完成熱身之後比賽正式開始，這裡標誌的起伏更大，而且也要同時注意與對手的身體衝撞，不過相對來講判定失敗的標準也低了很多，所以難度不是很大。
與赫敏發現羅恩與拉文德布朗在休息室親密的鏡頭，之後畫面轉向霍格沃茲的全景，開啟新的一天。
此時哈利需要找到盧娜去參加鼻涕蟲俱樂部的晚會。跟隨尼克找到盧娜，之後可以學會咒語Incendio並沿路點燃焰火跟隨指示回到城堡。跟隨盧娜來到斯拉格霍恩的辦公室。學會攪拌魔藥的方式並開始新的魔藥配製。
宴會途中跟蹤斯內普以及馬爾福離去，並偷聽到他們的談話。劇情轉到陋居，在此地突然發現貝拉特里克斯，哈利自然不會放過殺死小天狼星的凶手，決鬥再次展開。照之前講過的方法，使用Expelliarmus打敗她。用同樣的方法再次戰勝貝拉特里克斯以及狼人格雷伯克各一次後遊戲轉回霍格沃茲。
來到貓頭鷹處取信。之後去到魔藥辦公室，製作魔藥後開啟新的一天。
在休息室與赫敏對話後來到鄧不利多的辦公室，這時辦公室前的女孩告訴哈利她的物品被斯萊哲林的學生搶走了。首先來到外面的空地通過決鬥搶回物品後還給那個女孩，之後可以進入鄧不利多的辦公室。
與鄧不利多再次進入冥想盆的冥想，在這裡出現了一段令哈利不能理解的來自斯拉格霍恩與伏地魔之間關於魂器的回憶，原來斯拉格霍恩的這段回憶是他自己篡改過的。
出門後與赫敏來到變形廣場，與麥格教授對話後學會Levicerpus，在之後戰鬥當中可以逐漸熟悉這一咒語。不過顯然麥格教授顯然覺得簡單的決鬥對於哈利來講根本算不了什麼，緊接下來又要求哈利參加魁地奇的訓練。在之後的訓練中再次練習抓住金色飛賊。
與羅恩去製作魔藥，中途要解決一個斯萊哲林的小卒。路上遇到意外。兩人看到了拉文德布朗。不過明顯羅恩並不想見她。來到樓下，使用WingardiumLeviosa幫助拉文德將書放入書包，繼續與羅恩前往指定地點。在教室完成魔藥製作後再次出門找到羅恩，交談後羅恩離開，隨後解開新的區域。
跟隨尼克來到圖書館，這裡會碰到高爾以及克拉布，先後擊敗2人後兩人將門鎖住逃脫。此時哈利需要找到一個方法將大門打開。此處地上有鑰匙的碎片，先不要急於使用Reparo將鑰匙恢復。首先使用WingardiumLeviesa將鑰匙的碎片整體飛起，移動到鐵門前，連續向前推2下使碎片穿過大門，此時再使用Reparo，將鑰匙修復後，使用WingardiumLeviesa將其移動到開門機關即可通過。
之後發生羅恩誤服迷情劑的劇情，玩家改為控制羅恩。來到斯格拉霍恩的辦公室，開始製作迷情劑的解藥。服完解藥後的羅恩，卻因為斯格拉霍恩的酒而再次中毒，好在哈利及時用糞石解救了羅恩的性命。
羅恩雖然保住了性命，不過顯然不能再參加魁地奇比賽了，於是只好由麥克拉根來擔任守門員。熱身後開始比賽。再次以抓住金色飛賊作為比賽的終結。
開始全新的一天，與羅恩赫敏交談後找到凱蒂試圖瞭解馬爾福的陰謀，不過無功而返。之後發現馬爾福，要不斷地跟住馬爾福，在抓住他之後將其擊敗。卻不幸被斯內普發現，隨即出現哈利與金妮接吻的劇情。
該是為鄧不利多取得斯格拉霍恩的回憶的時候了，萬般無奈下哈利決定使用福靈劑來增加運勢。好運的哈利決定先去找海格，這裡哈利的移動是不需要控制的，而且趁著哈利好運，在路上大肆斬獲MiniCrest，可以獲得的數量比平常更多。
此時高爾和克拉布竟然還敢出來擋駕，簡直是自不量力。盡情的戰鬥吧，因為他們的攻擊根本無效，幹掉2人後在草藥教室發現斯格拉霍恩。製作完魔藥後與斯格拉霍恩找到海格，參加蜘蛛阿拉戈克的葬禮，並藉此機會取得斯格拉霍恩的回憶。
戰勝克拉布之後來到鄧不利多的辦公室，並進入斯格拉霍恩的回憶。由此而得之，伏地魔將自己的靈魂分成7塊，分藏於不同的魂器之中。
由於哈利被斯內普關了緊閉，只好由金妮代為出戰擔任找球手，依舊是熱身和比賽，控制金妮抓住金色飛賊後格萊芬多獲得了魁地奇比賽的冠軍。
來到草藥辦公室，在這裡的提示板前找到WiggenweldPotion製作完成，哈利喝掉它後獲得了更多的決鬥體力，找到鄧不利多，開始破壞魂器的歷程。
遊戲短暫交待了破壞魂器的旅程，這其中哈利要阻擋3個回合的來犯怪物來保護鄧不利多，之後與鄧不利多回到學校，而此時食死徒也同時進入學校。鄧不利多隨即被斯內普殺害。哈利開始追逐食死徒，展開殊死搏鬥。連續4場戰鬥後，遊戲結局揭示了斯內普"混血王子"的身份。冒險終結。
