誤解一：每日排便是正常的、也是最好的。胃腸病學專家認為，如果糞便不是太鬆軟或是太堅硬，人們從每天排便3次到每週3次都屬於正常範圍。也就是說，排便有規律並不意味著每天都應該排便，而是自始至終保持穩定一致的習慣。只有在排便頻率發生突然變化時，才應引起注意。
誤解二：大便應該很臭。大便的氣味不好聞，但也不應當有腐臭味。如果大便的氣味極度難聞，那麼可能是感染的跡象，如果不加以控制，可能會發展為節段性腸炎、乳糜瀉或潰瘍性結腸炎。
賈第鞭毛蟲病（一種寄生蟲感染）是讓大便氣味變得更臭的原因。如果排便時經常出現這種情況，就需要去看醫生。
此外，人們一整天都在放屁是正常和健康的現象，因為它是腸道細菌在對食物進行消化時所生成的天然副產品。但是，與大便一樣，放屁的氣味持續惡臭可能是某些嚴重疾病的跡象。
誤解三：結腸需要很好地衝洗。從長期來看，清洗結腸對健康很有害，它在沖刷掉壞細菌的同時也把好細菌沖刷掉了，更糟的是，結腸中並沒有太多壞細菌。
有近1000種細菌生活在結腸內，對最後階段的消化起到幫助作用，其中包括吸收水分、讓膳食纖維得到發酵和吸收維生素，特別是維生素K、維生素B1、B2等。清洗結腸的過程中，這些有益細菌和電解質會同時被沖刷掉。而且，清洗結腸常見的副作用包括脫水、直腸穿孔、空氣栓塞、血液感染和失去控制腸部肌肉的能力。
誤解四：多花些時間排便有益健康。長時間坐在馬桶上排便並不是個好習慣。首先，在馬桶上坐的時間太長易長痔瘡，會引起肛門放鬆，隨後是反覆對直腸周圍有助於控制排便的組織進行刺激，就會形成“肛墊”；它會導致痔瘡，或是這個部位的靜脈發炎。多項研究也發現，痔瘡患者更有可能在馬桶上長時間停留。其次是髒。大量研究表明，如廁時閱讀材料或使用智慧手機會導致人們受到糞便細菌的汙染。
誤解五：排便更多，體重減輕更多。這種看法似乎與物理學定律相吻合：有更多的物質從體內排出，體重自然就減輕了。實際上並非如此， 很多人喝瀉藥或飲用“減肥茶”，希望通過排便減掉熱量。但熱量吸收主要發生在小腸內，而瀉藥針對的部位是大腸或結腸。