紫檀木念珠的材料一般有小葉紫檀和大葉紫檀兩種，其中使用小葉紫檀製作飾品最為廣泛，而紫檀木念珠是人們最喜歡的佛教用具之一。為什麼選擇紫檀木製作佛具呢？帶紫檀木念珠對人體有什麼特殊的功效嗎？
中古世紀醫學界在消毒空氣方面曾採用紫檀木薰香法來淨化空氣以利醫療。其主要原因乃檀木燃燒會散發清幽芬芳香氣外，本質元素內含殺菌效益，更有穩神定氣之神效。黑檀色澤烏黑，質地緊密，香味淡雅悠長。用以裝飾盡顯莊嚴，佛教更認為檀木有驅邪避邪之效用。紫檀檀木所散發的香氣有益人體心臟、肝臟、腎臟等機能，能有效穩定人體腦波使情緒平衡、安祥、沉靜；助益睡眠，更有幫助禪定之效益。
在佛事生成的殿堂裡，煙馨繚繞的檀香在佛經中和定心、安神、醒腦、鎮邪、通竅連線在一起。紫檀念珠代表了百毒不侵、萬古不朽、邪不沾身的對入定誦經者的一種全方位的衛護。明朝李時珍《本草綱目》本部第三十四卷記載：“紫檀――鹹、微寒，無毒，能和營氣消腫毒”。它含紫檀素，紫檀素溶於酒精或醚，具收斂消腫毒效能，削片、鋸屑或磨汁供藥用，常用作治療毒瘡。可以抗白蟻及其它害蟲。