將各種方法（活檢、屍檢）獲取的組織標本經過一定的步驟處理，做成切片。蘇木素是鹼性染料，可將細胞核（嗜鹼性物質）染成藍色，伊紅是酸性染料，可將多數細胞的細胞質（嗜酸性物質）染成紅色，形成色彩鮮豔、結構清晰的組織影象。
工具/原料
1.屍檢來源的正常肺組織。
2. 器材 手術刀、恆溫箱、石蠟切片機、顯微鏡。
3. 試劑 10％福爾馬林，梯度酒精(70％、80％、90％、95％)，無水酒精，二甲苯，包埋石蠟，蘇木素染液，伊紅染液。
方法/步驟
1. 取材和固定 用鋒銳的手術刀細緻而迅速地取下一塊大小適宜(1.5×1.5×0.2 cm)的肺組織塊，立即投入10％福爾馬林內固定24 h，也可多放一段時間待用時取出（最好不要超過48h）。
2. 脫水 依次經過70％(2 h)、80％(2 h)、90％(2 h)、95％酒精(Ⅰ、Ⅱ 各2 h)和無水酒精(Ⅰ、Ⅱ各1 h)脫水，二甲苯透明(Ⅰ、Ⅱ 各1 h)，以置換組織內的酒精溶液。
3. 包埋 將透明好的組織塊置入已在溫箱(58℃～60℃)內熔化的石蠟內(Ⅰ、Ⅱ 各2 h)，使石蠟浸入組織並替換出二甲苯。在包埋器的內壁塗一層甘油，傾入熔化的石蠟，將浸透蠟的組織塊放入包埋器（待切面朝下），擺好間距和方位，待蠟液表面凝固後，將包埋器投入冷水浴中，使石蠟冷卻凝固。
4. 切片 將蠟塊固定於切片機，切成5μm厚的切片，在45℃的水面上展平後撈在塗有防脫劑的載玻片上，置60℃烤箱2h。
5. 脫蠟 二甲苯脫蠟（Ⅰ、Ⅱ 各15min)，不同濃度酒精（100％、95％、80％、70％）置換二甲苯並經蒸餾水水化後即可進行染色。
6. 蘇木精－伊紅染色 將經處理的組織切片置蘇木素染液中染5min，自來水沖洗，稀鹽酸分化後，置流水中充分沖洗返藍；伊紅染液染色2～3min，流水沖洗乾淨。
7. 脫水、透明和封固 染好的切片經梯度酒精脫水（70％、80％、95％、100％）各5min，二甲苯透明（Ⅰ、Ⅱ 各5 min)，在載玻片上加一滴中性樹膠，然後覆蓋一片清潔的蓋玻片。
8. 顯微鏡觀察。
注意事項
1. 每取完一例標本後，所有的工具如刀、剪、盤、鑷、切板等，必須用水沖洗乾淨，以免汙染。
2. 儘量保持組織的原有形態，勿使組織塊受擠壓，切取標本的大小不超過2.0 cm×2.0 cm×0.2 cm。
3． 依據組織塊大小確定脫水、透明和浸蠟時間。時間過長，組織塊過硬、變脆；時間不夠，則組織塊硬度不夠，且HE染色時核漿藍染，界限不清，不利於觀察。
4. 蘇木素染後應充分返藍，使細胞色彩鮮明，結構清晰。