Java實現生物資訊小軟體,通過Java對生物資訊學的一些演算法實現,例如序列比對,作圖,統計等。對序列的初步處理,匹配搜尋等。
工具/原料
Java
Netbeans
方法/步驟
開始介面建立,是一個開啟視窗,用於開啟檔案
JFileChooser包,以及JTextArea
序列比對之全域性比對。使用JTable作為結果顯示,使用Needleman_Wunsch、Smith_Waterman演算法
點陣圖,使用Graphics包進行繪圖。以影象的形式表示序列的相似性。
序列轉換,蛋白質核酸序列相互轉換。
模式序列搜尋及統計使用Sunday演算法。統計模式串的數量以及位置。
序列資訊統計,對核酸或蛋白質序列進行統計。對某些核酸的數量進行統計。
幫助文件
注意事項
相關程式碼不附上
對於Java需要熟悉