豆漿具有一定的營養和保健價值，富含蛋白質和鈣、磷、鐵、鋅等多種礦物質以及多種維生素，對預防高血脂、高血壓、動脈硬化、缺鐵性貧血、氣喘等疾病有不錯的效果，但是如果與藥物同時服，不僅會影響豆漿中營養成分的吸收，還可能傷了藥效。
有些藥物會破壞豆漿裡的營養成分，如四環素類（米諾黴素、多西環素）、紅黴素（克拉黴素、阿奇黴素、羅紅黴素）等抗生素。
豆漿也會影響藥物的吸收。豆漿含鈣量高，一旦和藥物裡的某些成分（如含鐵、鈣、鋁的製劑）發生化學反應，形成沉澱，長期處於這種情況可能出現結石。黃豆中的蛋白質會阻礙人體對鐵元素的吸收，如果您在吃補鐵食物或藥物，如硫酸亞鐵口服液的同時，喝了豆漿，鐵的吸收率會大大下降，鐵劑的作用難以完全發揮。
豆漿含有酸性物質，與酸性藥物如阿司匹林、維生素C等一起服下，會刺激胃酸分泌，造成胃部不適。如果它與鹼性藥物如碳酸鈣、氫氧化鋁、三矽酸鎂等同服用，則會降低藥物的療效。
豆漿還不宜與某些中藥一起服用。《本草綱目》記載黃豆“利水下氣，制諸風熱，解諸毒。”因此用黃豆製成的豆漿性寒，會使同服的寒性中藥，如黃連、黃芩、梔子等的寒涼性質加劇，可能損害元氣；如果同服的中藥是附子、肉桂、生薑等溫熱性的，豆漿會影響這些藥物作用，降低療效。
建議大家喝豆漿後，最好等30分鐘再吃藥，以免影響豆漿和藥物的吸收利用。如果正在服抗生素，服藥和喝豆漿的間隔則應該大於1小時。