目前口腔潰瘍病因不明，可能與下列因素有關：區域性或全身免疫功能紊亂；某些營養物質如微量元素或維生素缺乏；一定的家族遺傳背景；消化道功能與內分泌紊亂；病毒與幽門螺桿菌感染，以及精神心理因素等。但這些因素是口腔潰瘍的病因還是誘發因素，尚無明確結論，故醫家迄今未找到根治方法與特效藥物。
目前對此病的治療均為對症施治，而對症治療中，鐳射、燒灼、冷凍等方法不宜採用，值得推薦的是一般藥物療法。臨床經驗是，輕型口瘡可通過區域性治療消炎止痛，促進癒合。可推薦藥物有：
1，意可貼(敷劑)、華素片(含劑)、冰硼散(散劑)與金銀花咽爽含漱液(噴劑)。
2，如為重型、皰疹樣型口瘡，或者發作頻率在每月1次以上者，則應到口腔粘膜病專科接受治療，堅持中西藥物聯合運用原則。
3，可適當補充鐵、鋅、葉酸等微量元素和維生素，但不能防止潰瘍的復發，藥物可加速癒合。
4，中藥成分的像金銀花咽爽含漱液等這些被市場廣泛認可的保證效果且沒有副作用，針對的都是複發性口腔潰瘍的和白塞氏綜合恢復的，防止以後反反覆覆發作做好的藥，它主要通過恢復營養代謝，也就會伴隨口腔粘膜的免疫機能逐步恢復，一般使用3~5天，都能馬上緩解潰瘍痛苦，不要相信一兩天就能解決你的問題。