根據化合物質量數查找內源性代謝物?

體內的化合物都有一個確定的質量數,一般經質譜儀的分析後都能得到這個質量數。但是有了質量數如何確定是哪個或哪一些化合物呢,下面就介紹一下根據質量數確定化合物的方法。

工具/原料

HMDB數據庫

化合物質量數

方法/步驟

首先,打開HMDB數據庫,百度搜索即可。

根據化合物質量數查找內源性代謝物

點擊Search-MS search。

根據化合物質量數查找內源性代謝物

輸入質量數(以247.2348為例),調節正負模式(本例選Negative),選擇離子類型(本例選M-H),鍵入質量數範圍,一般是0.05Da,點擊Search。

根據化合物質量數查找內源性代謝物

彈出界面顯示,該質量數對應4個化合物。

根據化合物質量數查找內源性代謝物

點擊其中一個(如第一個)HMDB60512,彈出界面中查看化合物的信息。其餘三個化合物用同樣的方法來查看,還可以根據詳細的信息描述來最終確定化合物。

根據化合物質量數查找內源性代謝物

還可以查看該化合物對應的酶和基因等。

根據化合物質量數查找內源性代謝物

注意事項

HMDB數據庫還可以根據核磁數據以及結構式等來確定化合物,本例只說明根據質量數確定。

該方法只能鎖定一些化合物,專業的應用最好還要有標準品驗證。

相關問題答案