系統分析方法的具體步驟包括：限定問題、確定目標、調查研究收集資料、提出備選方案和評價標準、備選方案評估和提出最可行方案。
方法/步驟
1、限定問題。問題即現實情況與計劃目標或理想狀態之間的差距。系統分析的核心內容有兩個：其一是進行“診斷”，即找出問題是及其原因；其二是“開處方”，即提出解決問 題的最可行方案，所以限定問題是系統分析中關鍵的一步，因為如果“診斷”出錯，以後開的“處方”就不可能對症下藥。在限定問題時，要注意區別症狀和問題， 探討問題原因不能先入為主，同時要判別問題是區域性的還是整體的，問題的最後確定應該在調查研究之後。
2、確定目標。 系統分析目標的確定應該基於客戶的要求和對需要解決問題的理解，應儘量通過指標表示，進行定量分析，如果目標無法定量描述也應該儘量用文字說明清楚，以便定性分析和評價系統分析的成效。
3、調查研究，收集資料。 調查研究和收集資料應該圍繞問題起因進行，一方面要驗證有限定問題階段形成的假設，另一方面要探討產生問題的根本原因，為下一步提出解決問題的備選方案做準備。 調查研究常用的有四種方式，即閱讀檔案資料、訪談、觀察和調查。 收集的資料和資訊包括事實（facts）、見解(opinions)和態度(attitudes)。要對資料和資訊去偽存真，交叉核實，保證真實性和準確性。
4、提出備選方案和評價標準。 通過深入調查研究，問題得以最終確定，使產生問題的主要原因得到明確，在此基礎上就可以有針對性地提出解決問題的備選方案。備選方案是解決問題和達到諮詢 目標可供選擇的建議或設計，應提出兩種以上的備選方案，以便提供進一步評估和篩選。為了對備選方案進行評估，要根據問題的性質和客戶具備的條件。提出約束 條件或評價標準，供下一步應用。
5、備選方案評估。根據上述約束條件或評價標準，對解決問題備選方案進行評估，評估應該是綜合性的，不僅要考慮技術因素，也要考慮社會經濟等因素，評估小姐應該有一定代表性，除諮詢專案組成員外，也要吸收客戶組織的代表參加。根據評估結果確定最可行方案。
6、提交最可行方案。最可行方案並不一定是最佳方案，它是在約束條件之內，根據評價標準篩選出的最現實可行的方案。如果客戶滿意，則系統分析達到目標。如果客戶不滿意，則要與客戶協商調整約束條件或評價標準，甚至重新限定的問題，開始新一輪系統分析，直到客戶滿意為止。