（1）病原體不同。非淋菌性尿道炎的病原體是沙眼衣原體和支原體、白色念珠菌、陰道毛滴蟲等，而淋病的病原體是淋病雙球菌。
（2）臨床症狀不同。非淋菌性尿道炎的臨床症狀是分泌物呈乳白色，以慢性尿道炎的形式表現出來；而淋病的開始症狀是自尿道口流出大量黃色膿性分泌物，以急性尿道炎的形式表現出來。
（3）治療方法不同。非淋菌性尿道炎的治療藥物以四環素類、紅黴素藥物為主；而淋病的治療藥物以青黴素類、頭孢菌素類藥物為主。
相對於西醫與其他邊緣醫學，中醫藥具有以下幾大優勢：
首先，傳統中醫理論與系統論有相近之處，這是中醫藥最根本，最長久的優勢。中醫認為人體是一有機整體，相信有一種規律―― 天人合一 ――支配著人體的發展。人體各器官遵循這一規律在生理上相互聯絡，在病理上相互影響。因此，中醫的任務是通過望、聞、問、切，全面系統地瞭解病情，“辨證施治”；從而努力使人體做到天人合一，使各系統不越雷池一步，平衡氣血。比利時學者普利高津曾說：“中醫傳統的學術思想是著重研究整體和自發性，協調與協同，現代科學的發展更符合中醫的哲學思想。”
近幾年隨著人們生活水平的提高，一些疑難雜症越來越多，化學藥在治療這些疑難雜症方面沒有很好的優勢，往往因藥品的不良反應和療效不確切使病人不得不放棄化學藥物的應用而選擇中藥來治療。近年來出現的“非典”和今年出現的“手足口病”等的治療，中藥發揮了極大的治療優勢，人們越來越感覺到中藥的絕對優勢。針對以上中藥的種種優勢，使得人們對中藥的理解越來越重視，人們對中藥越來越認可，相信，隨著社會的不斷髮展，人們將會對中藥有更多、更科學的充分利用，使其能在當今乃至未來的醫療戰線上充分發揮著優勢.
中藥的有效成分不易散失，副作用小中藥在治療疾病過程中的途徑大致有以下方面：(1)中藥材直接煎熬成湯劑使用，它根據所用藥物的性味、質量輕重、藥物的部位不同來隨時確定煎煮的時間、火候等。（2）把中藥材經過簡單的物理加工，提煉成不同的劑型而服用。這兩種途徑很少有化學反應，故有效成分不易散失，副作用小。