LinkLab原創:META分析軟體的選擇?

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所謂“工欲善其事,必先利其器”,隨著循證醫學的發展,META分析已被公認為客觀評價和合並針對某一特定問題研究證據的最佳手段,想要做好META分析,離不開合適的META分析工具。在琳琅滿目的各種META分析軟體中,該選擇哪一款?究竟是免費的好還是收費的好?這是一個大問題!

目前常用的Meta分析軟體大抵可分為兩種,程式設計軟體和非程式設計軟體。其中好評如潮的Stata和R軟體均屬於程式設計軟體,這類軟體的優點在於其開放式的程式設計環境,這就意味著會有不少統計學家為它們量身打造各種優秀的可用於Meta分析的擴充套件包,作為終端使用者只需要在網路上搜尋到這些擴充套件包,就可以直接坐享其福;當然,使用者也必須對軟體的基本模組和命令有一定的瞭解。另一類非程式設計軟體,如RevMan和Meta-Analyst都屬於Meta分析專用軟體,這類軟體多來源於官方,易於操作、介面簡潔友好,操作性更高,但其分析模式和功能相對更為固定。

1. RevMan:Cochrane協作網META分析軟體

RevMan(Review Manager)是國際Cochrane協作網提供給評價者準備和維護更新Cochrane系統評價而設計的軟體,也可以說是專門為臨床醫生量身定做的Meta分析軟體,它不僅可以協助我們完成Meta 分析的計算過程,還可以幫助我們瞭解Meta分析的架構並學習系統評價的方法,最後把完成的系統評價製作成易於通過電子轉換的檔案以標準統一的格式傳送到CDSR,便於電子出版和日後更新。

RevMan是所有Meta分析軟體中唯一可與GRADEprofile軟體相互匯入進行證據等級評級的軟體,也是當前醫學領域應用最廣泛的Meta分析軟體。RevMan軟體中設定了干預措施系統評價、診斷試驗精確性系統評價、方法學評價和系統評價彙總評價4類格式,可繪製森林圖及漏斗圖,但不能進行Meta迴歸分析、累積Meta分析、BeggS檢驗、EggerS檢驗及繪製拉貝圖等。

RevMan是一款可以免費下載及使用的軟體,能夠輸入中文,除以上功能外,最新版RevMan還具有風險偏倚評估工具表、證據結果總結表、計算器(可輸入效應量、可信區間、標準誤、Z值、P值進行效應值的轉化)、PRISMA文獻檢索流程圖、森林圖小數位數的調整等。

2. Stata:功能強大的META分析軟體

Stata是基於C語言的一款功能強大而又小巧玲瓏的統計分析軟體,最初由美國計算機資源中心研製,現為Stata公司的產品。

Stata的許多高階統計模組均是程式檔案(ado檔案),並允許使用者自行修改、新增和釋出ado檔案,使用者可以隨時到Stata網站或者其它個人網站上搜索並下載所需的程式安裝包並使用。

Meta分析通過Stata的meta.ado模組完成,包括metan、metareg、metabias等常用命令,可完成二分兩變數、連續型變數、診斷試驗、單純P值、單組率、劑量反應關係、生存資料的Meta分析,也可以完成Meta迴歸分析、累積Meta分析、網狀Meta分析等幾乎所有的Meta分析方法,還可以進行BeggS檢驗、EggerS檢驗,可繪製Meta分析的相關影象,如森林圖、漏斗圖和拉貝圖,也可排除單個研究行敏感性分析。

Stata是目前Meta分析人群中最受推崇的軟體,國外高質量軟體業更傾向於接受Stata Meta分析圖形介面。

3. R:META分析全才

R軟體是屬於GNU系統的一個自由、免費、原始碼開發的軟體,由奧克蘭大學的志願者開發,目前由R核心開發小組維護。R軟體具備完整的資料處理、計算和作圖功能,相對於其他軟體。

它的特色在於:

n 有效的資料儲存和處理;

n 有用一整套陣列和矩陣運算工具;

n 完整連貫的統計分析工具,大多數經典的統計方法和最新的技術都可以再R中直接得到;

n 優秀的統計繪圖功能;

n 完善、間接和高效的程式語言。

R是自由軟體,但是它的能力不會比任何同類型商業軟體差,大多數人用R就是因為它的統計功能。它的部分統計功能整合在R語言底層,大多數功能也可以程式包的形式提供。目前常用的程式包有metafor、meta、rmeta等。擴充套件的程式包使大部分終端使用者可以通過搜尋擴充套件包,不僅可完成經典的Meta分析功能,一些新近出現的Meta分析方法如網路Meta分析等,也可以在R中完美實現,從某種意義上講,R軟體堪稱Meta分析全才。

4. Meta-Analyst:免費的Meta分析專用軟體

Meta-Analyst是一款基於微軟網路框架(Microsoft. NET framework)的免費Meta分析專用軟體,它是Tufts循證實踐中心受美國衛生保健保健和質量管理局(AHRQ)委託編制,被AHRQ指定為循證實踐中心專用Meta分析、提供證據報告的軟體而廣泛應用。

5. MIX:教學和實現Meta分析的自由軟體

MIX是一款基於Excel 2000及以上版本的,採用VB語言編寫的Meta分析軟體,只能運行於Windows系統。MIX 1.7版以前均為免費,而更新的新版本則分為了縮減(Lite)版和專業(Pro)版,前者免費只能用於Meta分析的學習,使用者不能建立資料進行Meta分析。收費的專業版則可以實現Meta分析,主要適用於治療性研究、佇列研究和病例對照研究等因果關係的研究。

6. Meta-DiSc:診斷性試驗Meta分析工具

Meta-DiSc軟體是一款基於VB語言,由西班牙衛生部門基金資助,專門用於診斷試驗的Meta分析軟體。Meta-DiSc軟體可進行異質性檢驗及Meta迴歸分析,也可生成森林圖、ROC平面及SROC曲線圖。

除上述軟體以外,常用的META分析軟體還有CMA、MetaWin等。我們在選擇時除了根據其程式設計環境的開放性進行選擇外,更為重要的一點是,我們需要明確增加的分析需求,因為有的軟體可以進行各種META分析,但有的僅僅針對某一種型別的META分析。

原作者: LinkLab

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