從合肥轉註冊到南京，一級建造師變更註冊流程如下：
1、與南京掛靠單位確定協議後，登錄建設部中國建造師網，點擊一級建造師註冊管理系統，在個人版憑姓名、身份證號、密碼等進入系統，在變更註冊欄填寫新單位名稱後選擇確定，再保持；
2、通知合肥原單位在企業版點擊同意調出；
3、通知南京新單位在企業版點擊同意調入，上報，並打印出一級建造師變更註冊申請表、審批意見表，蓋章，出具勞動合同及在崗承諾書，一起移交給楊先生；
4、移交原單位蓋章，原單位同時出具解聘證明；帶以上資料及身份證原件及複印件、註冊證原件及複印件、印章到合肥市建設局蓋章，再到安徽省建設廳蓋章；
5、以上資料、證件及畢業證、資格證移交南京新單位，送交江蘇省建設廳行政審批中心辦理審批手續。
一般而言，一級建造師變更註冊跨省的，大約需要一週時間辦理完畢。