香港公司註冊後，日後的管理比較簡單。公司在香港成立後，週年日翌日起至一年，每年必須向香港公司註冊處和稅務局週年申報並更新商業登記一次，此費用隨政府的調整而浮動。
香港公司相關
香港公司年審逾期罰款
稅務局商業登記證逾期罰款300元港幣；
註冊香港公司處週年申報按逾期的時間進行罰款：
如在由成立為法團的週年日翌日起計42天內 罰款：HK$105
如在由成立為法團的週年日翌日起計超過42，天但不超過3個月 罰款：HK$870
如在由成立為法團的週年日翌日起計超過3個月，但不超過6個月 罰款：HK$1,740
如在由成立為法團的週年日翌日起計超過6個月，但不超過9個月 罰款：HK$2,610
如在由成立為法團的週年日翌日起計超過9個月 罰款：HK$3,480
辦理香港公司註冊年審後給客戶的檔案
（1） 更新後的商業登記證
（2） 週年申報表
（3） 董事會議記錄
提供的資料：
（1） 香港公司註冊商業登記證影印件；
（2） 註冊證書影印件；
（3） 公司章程1本；
（4） 成立公司全套法定檔案影印件（NC1或者上一年度週年申報表）；
（5） 股東或董事身份證明檔案影印件（以遞交到政府備案的為準）；
（6） 改股、增資、改名相關檔案影印件（如未有涉及到相關事項的，可不必理會此條）；
（7） 親自簽署確認書並交付全款；
（8） 親自簽署週年申報檔案；
注意事項
不進行週年申報的後果
香港公司成立後每年必須遞交週年申報表。不進行週年申報，公司將會面臨罰款，而股東或董事個人也將會面臨檢控，如果罪名成立，將面臨最高5年刑期。
香港公司不年審香港註冊處和稅務局會有罰款，另外如果沒有在政府規定的時間內交罰款，您將會收到法院傳票，（香港公司董事先繳交香港註冊處和香港稅局的所有費用和罰款,再按傳票指定時間去香港指定法院聆訊。如香港公司董事不方便出庭聆訊,亦須委派獲正式授權的代表出庭。法院會根據具體情況,宣判罰款。）如一直都沒有做迴應，香港註冊處也會在一定時間內作出該公司自動登出的舉措。當然該公司的董事會入政府的黑名單，如果以後想在香港繼續辦理公司，或進行其他的一些活動都會非常的不方便。香港公司不準備年審的公司建議是在需要年審時間前42天遞交申請（如公司開設銀行的，建議客戶在3個月之前提出申請登出）
錯誤認識
即使是一家沒有營運的公司也是需要提交報稅表的, 因為稅務局需要根據報稅表來評定公司是否需要繳稅, 在沒有收到稅務局發出的通知前, 所有公司公司都要提交報稅表。 每家公司都要儲存妥當的帳目和資料至少7年，並不是說審計做了，審計報表提交了，那些基礎資料便可丟掉，只儲存報表，稅務局要求儲存的包括基礎資料。另一方面，有些公司只儲存基礎資料和報表,，由資料整理到報表之間的會計帳目, 例如銷貨帳, 購貨帳, 總帳, 現金帳, 銀行帳對數等等, 都不儲存下來。當然, 有些公司甚至不整理這些帳目, 這些情況是不被稅務局接受的，可能會被罰款。所提交的報稅表, 也就是沒有足夠支援, 可能引至"估稅" 的發生, 後果是很嚴重。