若想利用ChemBioDraw取代基屬性進行搜尋查詢就需要使取代基框中取代基子結構標記應與父結構用連線點相連線，要標記連線點，使用【連線點】工具，更多相關教程盡在（chemdraw中文官網）。
工具/原料
chemdraw
方法/步驟
一、子結構的連線點
1、選擇【連線點】工具；
2、在子結構要放置連線點的位置上（下圖左一藍色陰影處）單擊，單擊後該位置會出現一個連線點編號；
3、對所有子結構重複以上操作。
二、連線點的編號
如果在Preferences對話方塊中選擇了Building/Display下的Show Attachment Rank Indicators（顯示等級指示號），將會在文件視窗看見連線點編號。這些編號對應ChemBioDraw取代基父結構上的鍵等級數，指示子結構是如何連線在父結構上。對於子結構而言，連線點編號與鍵形成一個組合鍵。
當建立一個已經含有定義的ChemBioDraw取代基的父結構（化合物），再單擊【連線點】工具時，取代基標記的附近會自動出現一個等級數（下圖右一紅框內）。鍵等級數與定義中連線點的編號是一致的。下圖左一為父結構，中間為取代基框，右一為等級數出現。
三、F1查詢檔案
在ChemBioDraw 查詢結構中，完成了的查詢可被儲存為F1查詢檔案。F1查詢檔案中未在ChemBioDraw取代基框中的將被解釋為G0。以G-基團為例，如果取代基標記不是G1、G2、G3等，在寫到F1查詢格式時將被重新命名。