在淨化水設備中，一般來講原水中均含有一定量的微生物（細菌、真菌、病毒、細菌），微生物進入反滲透系統之後，找到了水中溶解性的有機營養物，這些有機營養物伴隨著反滲透過程的進行濃縮富集在反滲透膜表面上，從而形成生物膜的理想環境造成膜元件的生物汙染，生物汙染將嚴重影響反滲透系統的性能使得進水至濃水間的壓差迅速增加，導致膜元件發生“望遠鏡”現象與機械損壞以及膜產量的下降。
方法/步驟
1.活性炭吸附：用活性炭吸附水中有機物減少微生物的營養源，但吸附有機物的活性炭又成為營養充足的微生物理想繁殖場所；
2.紫外線殺菌：水經過紫外線照射後，細菌的細胞核中脫氧核糖核酸和細胞質中的核糖核酸吸收了波長為250—265nm的紫外線能，而被破壞導致細菌死亡。但由於水中的濁度、色度、藻類以及某些離子會減弱紫外線殺菌的作用，因此應該將紫外線殺菌器安裝在預處理設備之後；
3.混凝：微生物可視為膠體帶負電荷，用常規預處理方法如混凝、澄清和過濾可除去大部分，但很難徹底去除；
4.超濾：超濾膜具有較強的的過濾細菌能力，但不能保證徹底除菌，為了防治被截留細菌在超濾中大量繁殖，必須定期清洗超濾器，包括快速沖洗、反洗、藥洗和殺菌等；
5.殺菌劑殺菌：用殺菌劑控制微生物非常有效，常見的殺菌劑為具有氧化能力的化合物如CI2、NaCIO、O3、KmnO4等。殺菌劑的加藥點應該儘可能安排在靠前工序中，以便有足夠的接觸時間使得在進水膜裝置之前完成消毒過程；
6.電子除菌：電子除菌器實際上是一個低壓電解槽，被處理水通過電解槽，帶負電荷的細菌吸引到正極，細菌的細胞與電極間產生的電子轉移反應降低了細胞的吸氧活性；
7.定期消毒：即使採用了上述殺菌手段，細菌仍會有少量存活。因此有必要進行定期消毒。
注意事項
溫馨提示：電子殺菌和臭氧殺菌具有一定危險性，非專業人士請勿擅自進行殺菌操作；